Modèles en biologie (L3)

Cours de L3 : modèles matriciels en biologie, chaînes de Markov, distances, classification, information et analyse en composantes principales.

Ce cours présente des outils mathématiques pour modéliser des phénomènes biologiques et analyser des données : modèles matriciels, chaînes de Markov, géométrie, classification et analyse en composantes principales.

Les supports sont proposés sous deux formes : les transparents HTML interactifs et une version PDF imprimable, avec quatre diapositives par page.

Illustration reliant un réseau de cellules biologiques à un nuage de points et ses directions principales

Cours

Séance Thème HTML PDF
C1 Modèles et vecteurs Transparents Version imprimable
C2 Systèmes linéaires et pivot de Gauss Transparents Version imprimable
C3 Matrices et dynamiques : chaînes de Markov Transparents Version imprimable
C4 Géométrie : produit scalaire, distance et projection Transparents Version imprimable
C5 Distances et similarités Transparents Version imprimable
C6 Clustering : inertie, k-means et classification hiérarchique Transparents Version imprimable
C7 Information et entropie Transparents Version imprimable
C8 Variance, covariance et corrélation Transparents Version imprimable
C9 Analyse en composantes principales Transparents Version imprimable

Travaux dirigés

Livret de TD étudiant — version PDF sans corrigés.

Corrections

Corrigé du TD 3 — exercices 1 et 2 — calculs euclidiens et profils d’expression (PDF).